Het belangrijkste verschil tussen Alpha en Beta Tubulin is dat de alfatubuline Asp-254 bevat op de E-site, terwijl de beta-tubuline Lys-254 op de N-site bevat. Afgezien daarvan is GTP altijd gehecht aan de alfa-tubuline-subeenheid, terwijl bij de beta-tubuline-subeenheid GTP uitwisselbaar is voor de microfilamenten om te polymeriseren.
Microtubuli maken deel uit van het cytoskelet van het cytoplasma van de eukaryote cel. Daarom bestaan microtubuli als een netwerk van eiwitfilamenten die door de cel zijn verdeeld en die een bepaalde vorm aan de cel geven en de organellen op hun plaats houden. Bovendien zijn ze samengesteld uit twee belangrijke tubuline-eiwitten, namelijk alfa- en bètatubulines. Alfa en bèta zijn twee families van eukaryote tubuline-superfamilie. Alfa- en bètatubuline bestaat als een dimeer en is de basisbouwsteen van microtubuli.
