De belangrijk verschil tussen genoom en genenpool is dat het genoom verwijst naar het volledige DNA van een organisme, terwijl de genenpool verwijst naar de complete set van unieke genen van een kruisingpopulatie.
Gen is de fundamentele structurele eenheid van de erfelijkheid. Genen gaan via gameten van ouder op nakomeling over. Ze zijn ook aanwezig in het genoom van een organisme. Genoom is de complete set DNA van een organisme. Genenpool is ook een vergelijkbare term. Maar het vertegenwoordigt de verzameling van alle genen die aanwezig zijn in een populatie of soort. In tegenstelling tot genoom is genenpool een mengsel van genen van een populatie. Dienovereenkomstig vertegenwoordigt de genenpool alle mogelijke allelen die in die specifieke populatie aanwezig zijn.