Het belangrijkste verschil tussen koolhydraten en lipiden is dat de koolhydraten directe energiebronnen zijn in levende organismen, terwijl de lipiden fungeren als een energiebron voor de lange termijn en de neiging hebben om langzamer te worden gebruikt.
Koolhydraten en lipiden zijn belangrijke voedingsstoffen in levende organismen. Het zijn organische verbindingen en ze dienen als belangrijke energiebronnen. Daarom nemen we koolhydraten en lipiden uit onze voeding, omdat ze essentieel zijn voor een gezond lichaam. Zowel koolhydraten als lipiden bestaan uit koolstof, waterstof en zuurstof. Structureel gezien zijn koolhydraten polymeren die in verschillende vormen voorkomen, zoals monosachariden, disachariden en polysachariden. Aan de andere kant is lipide een niet-polymeer molecuul dat een glycerolmolecuul en drie vetzuurketens vormt.