Het belangrijkste verschil tussen polysaccharide- en geconjugeerde vaccins is dat polysaccharidevaccins alleen vrije polysacchariden als antigenen bevatten, terwijl geconjugeerde vaccins polysacchariden bevatten in combinatie met een eiwitmolecuul.
Polysaccharide- en geconjugeerde vaccins zijn twee soorten vaccins. Polysaccharidevaccins bevatten alleen de polysaccharidecapsule als antigeen om een immuunrespons te stimuleren. Daarom veroorzaken ze een verwaarloosbare immuunrespons in vergelijking met geconjugeerde vaccins. Conjugaatvaccins bevatten polysacchariden die zijn geconjugeerd aan een immunogeen eiwit. Daarom lokken ze een sterkere immuunrespons uit. Bovendien vestigen geconjugeerde vaccins B-celgeheugen en langdurige immunisatie. Op dit moment hebben geconjugeerde vaccins de polysaccharidevaccins enorm vervangen.
