Het belangrijkste verschil tussen glucogene en ketogene aminozuren is dat de glucogene aminozuren pyruvaat of andere glucosevoorlopers produceren tijdens hun katabolisme, terwijl ketogene aminozuren acetyl CoA en acetoacetyl CoA produceren tijdens hun katabolisme.
Aminozuren zijn de fundamentele moleculen die de chemische structuur van eiwitten en polypeptiden vormen. Hoewel er verschillende classificaties zijn voor aminozuren, kunnen we ze classificeren als glucogene en ketogene aminozuren, afhankelijk van de tussenproducten die ze vormen tijdens hun katabolisme. Zoals hierboven vermeld, levert het eindproduct van de afbraak van aminozuren twee soorten tussenproducten op; ofwel pyruvaat (of naar andere glucosevoorlopers) of acetyl CoA en acetoacetyl CoA.
