De belangrijk verschil tussen prokaryote en eukaryote transcriptie is dat de prokaryote transcriptie plaatsvindt in het cytoplasma, terwijl de eukaryote transcriptie plaatsvindt in de kern.
In een cel draagt DNA informatie van generatie op generatie die de activiteiten van een cel bestuurt. Bovendien is DNA verantwoordelijk voor het synthetiseren van alle eiwitten die zowel een functionele als een structurele rol spelen in een cel. Daarom controleert DNA door het synthetiseren van dergelijke eiwitten de activiteiten van een cel. Een gen dat de genetische informatie bevat om een eiwit te produceren, moet tot expressie worden gebracht om het respectieve eiwit te synthetiseren. Genexpressie vindt plaats via twee hoofdstappen, namelijk transcriptie en vertaling. Daarom is transcriptie de eerste stap van genexpressie. Het wordt gevolgd door vertaling. Tijdens de transcriptie verandert de genetische informatie over DNA in een drieletterige genetische codesequentie in het mRNA. Tijdens de vertaling wordt het mRNA omgezet in een keten van polypeptiden.
