Het belangrijkste verschil tussen prokaryote en eukaryote ribosomen is dat de prokaryote ribosomen 70S-deeltjes zijn die zijn samengesteld uit 50S grote subeenheid en 30S kleine subeenheid, terwijl de eukaryote ribosomen 80S-deeltjes zijn die zijn samengesteld uit 60S grote subeenheid en een 40S kleine subeenheid.
Prokaryoten en eukaryoten zijn twee hoofdgroepen van levende organismen die verschillen van de cellulaire organisatie. Prokaryoten hebben geen kern en membraangebonden celorganellen. Aan de andere kant hebben eukaryoten een kern en membraangebonden celorganellen. Er zijn enkele organellen die beide organismen gemeen hebben. Het ribosoom is een van de belangrijke en vitale organellen die aanwezig zijn in zowel prokaryote als eukaryote cellen. Ze zijn aanwezig in het cytoplasma van elke cel. Structureel vormen proteïne en ribosomaal RNA (rRNA) samen ribosomen. En ze bestaan uit twee subeenheden, namelijk een grotere subeenheid en een kleine subeenheid. Ze voeren ook dezelfde functie uit, namelijk de vertaling van mRNA-moleculen in eiwitten. Omdat translatie een essentieel proces is voor alle levende organismen en het voorkomt in de ribosomen,ribosomen zijn erg belangrijk voor zowel prokaryoten als eukaryoten. Ondanks dat er veel overeenkomsten zijn, zijn er enkele verschillen tussen prokaryote en eukaryote ribosomen.