Het belangrijkste verschil tussen motorische en sensorische homunculus is het type verwerking dat elk ondergaat tijdens neurologische mapping. Motorhomunculus is een kaart die de motorische verwerking van de verschillende anatomische delen van het lichaam laat zien, terwijl sensorische homunculus een kaart is die de sensorische verwerking van de verschillende anatomische delen van het lichaam laat zien.
Homunculus is een denkbeeldige kaart die is gegenereerd op basis van de beschikbare gegevens over de verschillende neurologische verbindingen. Het betreft voornamelijk de hersenen, sensorische verwerking en motorische verwerking. Verder spelen zenuwen en het ruggenmerg ook een belangrijke rol bij het genereren van de homunculus.