Het belangrijkste verschil tussen agarput en schijfdiffusiemethode is dat bij de agarputdiffusiemethode de extractoplossing wordt gevuld in een gat of een put die op het agarmedium is gemaakt, terwijl bij de agar-schijfdiffusiemethode een filtreerpapier schijf met de testoplossing is geplaatst op het agaroppervlak.
Micro-organismen zijn de veroorzakers van veel ziekten. Er zijn verschillende antimicrobiële middelen die micro-organismen doden en hun groei remmen of stoppen. Er zijn verschillende screening- en evaluatiemethoden beschikbaar voor het detecteren van antimicrobiële activiteit. Onder hen zijn agarputdiffusiemethoden en agarschijfdiffusiemethoden veelgebruikte methoden in in vitro analyse, die agardiffusiemethoden zijn. Deze methoden worden op grote schaal gebruikt omdat ze geen specifieke apparatuur en verdere evaluatie op reproduceerbaarheid en standaardisatie vereisen. Beide methoden zijn afhankelijk van de diffusie van het antimicrobiële middel door het agarmedium.