Het belangrijkste verschil tussen DNA- en RNA-nucleotide is dat DNA-nucleotide of deoxyribonucleotide deoxyribosesuiker bevat, terwijl RNA-nucleotide of ribonucleotide ribosesuiker bevat.
Nucleotiden zijn de basiseenheid van nucleïnezuren. Het zijn de bouwstenen of monomeren van DNA en RNA. Ze verbinden zich met elkaar om een polynucleotideketen te vormen, die de structuur geeft aan DNA of RNA. Er zijn drie hoofdcomponenten in een nucleotide. Ze zijn een stikstofhoudende basis, een pentosesuiker (suiker met vijf koolstofatomen) en fosfaatgroepen. Er zijn vijf verschillende stikstofhoudende basen zoals Adenine, Thymine, Cytosine, Guanine en Uracil. Thymine wordt alleen in DNA gezien, terwijl uracil uniek is voor RNA. Er zijn twee soorten vijf koolstofsuikers in nucleïnezuren. RNA bevat ribosesuiker, terwijl DNA deoxyribosesuiker bevat. Nucleotiden bevatten drie fosfaatgroepen die aan de pentosesuiker zijn gehecht.
