Het belangrijkste verschil tussen DNA-RNA-hybriden en dsDNA is dat DNA-RNA-hybriden dubbelstrengige nucleotiden zijn die zijn samengesteld uit één DNA-streng en één complementaire RNA-streng, terwijl dsDNA een dubbelstrengs DNA is dat is samengesteld uit twee complementaire DNA-strengen.
In zijn oorspronkelijke staat is DNA dubbelstrengs. Het heeft twee complementaire DNA-strengen die zijn verbonden via waterstofbruggen. RNA is enkelstrengs in zijn oorspronkelijke structuur. In sommige gevallen vormt RNA duplexen met DNA. Ze staan bekend als DNA-RNA-hybriden. Ze worden voornamelijk gevormd tijdens de transcriptie en vermenigvuldiging van oncogene RNA-virussen. In vergelijking met dsDNA zijn DNA-RNA-hybriden stabieler.
