Het belangrijkste verschil tussen homonucleaire en heteronucleaire aromatische verbindingen is dat de homonucleaire aromatische verbindingen atomen bevatten van dezelfde chemische elementen in de ringstructuur, terwijl de heteronucleaire aromatische verbindingen atomen van verschillende chemische elementen in de ringstructuur bevatten.
Homonucleaire en heteronucleaire aromatische verbindingen zijn organische verbindingen die ringstructuren bevatten. En deze ringstructuren bevatten identieke atomen of verschillende atomen. Daarom hebben ze verschillende chemische en fysische eigenschappen, afhankelijk van het type atomen in de ringstructuren.