Het belangrijkste verschil tussen Genetic Map en Physical Map zit in de technieken die worden gebruikt bij het in kaart brengen van het genoom. Bij het genereren van een genetische kaart worden genetische markers en genetische loci gebruikt om de genkoppelingspatronen te bestuderen, terwijl bij fysieke mapping gebruik wordt gemaakt van moleculaire biologietechnieken zoals Restrictie Fragment Lengte Polymorphism (RFLP) en hybridisatietechnieken.
Genetische kaarten en fysieke kaarten twee soorten kaarten die construeren om de genen in chromosomen te tonen. Ze houden zich bezig met genetische diagnostiek en om evolutie te voorspellen met betrekking tot genoomanalyse. Bovendien gebruiken ze om de afstanden tussen genloci te analyseren en om genpolymorfismen te analyseren.
