Het belangrijkste verschil tussen de ziekte van Paget en eczeem is dat de ziekte van Paget een focale aandoening is van botremodellering, en eczeem is een inflammatoire aandoening van de huid die wordt gekenmerkt door groepen vesiculaire laesies met een variabele mate van exsudaat en schilfering.
De ziekte van Paget treedt op vanwege de mutaties in bepaalde genen, zoals nucleaire factor kappa B, sequestosoom p62 en osteoprotegerine. Aan de andere kant treedt eczeem op als gevolg van overgevoeligheidsreacties tegen verschillende allergenen. Dit verschil in pathogenese is het belangrijkste verschil tussen de twee ziekten.
