Het belangrijkste verschil tussen cis- en transvetzuren is dat de cis-vetzuren twee waterstofatomen hebben die zijn bevestigd aan de dubbele binding aan dezelfde kant van de koolstofketen, terwijl de transvetzuren de twee waterstofatomen hebben die zijn gebonden aan de dubbele binding in het tegenovergestelde zijkanten van de koolstofketen.
Vetzuren zijn carbonzuren die lange alifatische koolstofketens bevatten die verzadigd of onverzadigd zijn. Dit betekent dat de alifatische keten al dan niet dubbele bindingen tussen de koolstofatomen kan bevatten. Cis- en transvetzuren zijn twee vormen van onverzadigde vetzuren.
