Het belangrijkste verschil tussen borazine en benzeen is dat het borazine drie booratomen en drie stikstofatomen in de ringstructuur bevat, terwijl het benzeen zes koolstofatomen in de ringstructuur bevat.
Zowel borazine als benzeen hebben vergelijkbare structuren met een zesring, en deze twee verbindingen zijn iso-elektronisch. Dat betekent dat zowel borazine als benzeen hetzelfde aantal elektronen of dezelfde elektronische structuur hebben. Ze hebben echter totaal verschillende chemische en fysische eigenschappen omdat de ringen van deze verbindingen uit verschillende atomen bestaan.