Het belangrijkste verschil tussen bacteriën en eukaryoten is dat de bacteriën een echte kern en membraangebonden organellen missen, terwijl de eukaryoten een echte kern en membraangebonden organellen hebben.
De cel is de fundamentele functionele en structurele eenheid van alle levende organismen. Afhankelijk van de basisstructuur van de cel, zijn er twee basiscategorieën van organismen, namelijk prokaryoten en eukaryoten. Prokaryoten zijn eencellige organismen met eenvoudige celstructuren. Ze omvatten twee hoofdgroepen; Bacteriën en Archaea. Aan de andere kant hebben eukaryoten complexe cellulaire structuren met goed georganiseerde cellen. Ze omvatten protisten, schimmels, planten en dieren. Omdat zowel bacteriën als eukaryoten levende organismen zijn, hebben ze enkele overeenkomsten, zoals het hebben van een celmembraan, ribosomen, DNA dat genetische informatie bevat, enz. Echter, aangezien bacteriën prokaryoten zijn, vertonen bacteriën en eukaryoten veel structurele en functionele verschillen met eukaryoten. Dit artikel is bedoeld om het verschil tussen bacteriën en eukaryoten te benadrukken.
