De belangrijk verschil tussen mycoplasma en chlamydia is dat mycoplasma een geslacht van bacteriën is dat geen celwand heeft, terwijl chlamydia een geslacht is van bacteriën dat gramnegatieve en obligate parasieten omvat.
Mycoplasma-soorten zijn de kleinste bacteriën die tot nu toe zijn ontdekt, met de kleinste genomen en een minimum aan zeer essentiële organellen. Mycoplasma is een muurloze bacterie. Daarom hebben ze geen duidelijke vorm. Over het algemeen zijn ze bolvormige tot draadvormige cellen. Chlamydia daarentegen is een geslacht van bacteriën met celwanden. Het zijn gramnegatieve bacteriën. Zowel mycoplasma als chlamydia veroorzaken seksueel overdraagbare aandoeningen. Bovendien produceren ze vergelijkbare symptomen, maar ze kunnen met verschillende antibiotica worden behandeld.
