Het belangrijkste verschil tussen koolstofcyclus en fosforcyclus is dat de koolstofcyclus de biogeochemische cyclus is die de beweging van koolstof door de lithosfeer, hydrosfeer, biosfeer en atmosfeer beschrijft. Ondertussen beschrijft de fosforcyclus de beweging van fosfor door de lithosfeer, hydrosfeer en biosfeer.
Koolstof, stikstof en fosfor zijn drie belangrijke elementen die belangrijk zijn voor alle levende wezens. De circulatie van deze elementen via biotische en abiotische componenten die aanwezig zijn in de ecosystemen of het milieu, wordt beschreven door hun biogeochemische cycli. Koolstofcyclus verklaart de circulatie van koolstofelementen door lucht, bodem en water, terwijl de fosforcyclus het gedrag van fosfor door bodem en levende organismen verklaart. Een van de belangrijke verschillen tussen koolstofcyclus en fosforcyclus is dat koolstof voornamelijk door de atmosfeer beweegt, terwijl fosfor geen interactie heeft met de atmosfeer.
