Het belangrijkste verschil tussen Prototheria Metatheria en Eutheria is dat Prototheria verwijst naar eierleggende zoogdieren, terwijl Metatheria verwijst naar buideldieren die gedeeltelijk ontwikkelde jongen baren, en Eutheria verwijst naar placentale zoogdieren die goed ontwikkelde jongen baren.
Op basis van de grote variaties in voortplantingssystemen, kunnen zoogdieren worden onderverdeeld in drie subklassen: prototheria, metatheria en eutheria. Prototheria omvat de meest primitieve zoogdieren, die eierleggende zoogdieren zijn, vooral monotremes. Metatheria omvat buideldieren, terwijl Eutheria echte placentale zoogdieren omvat. In feite is Eutheria de grootste subklasse van zoogdieren.
