Het belangrijkste verschil tussen biomining en bioleaching is dat biomining de techniek is waarbij prokaryoten of schimmels worden gebruikt om metalen uit mineralen te extraheren, terwijl bioleaching de techniek is waarbij bacteriën worden gebruikt om metalen uit mineralen te extraheren.
Er zijn verschillende methoden die kunnen worden gebruikt om metalen uit hun erts of mineraal afval te halen. De meeste van deze technieken gebruiken chemische reagentia voor deze extractie. Daarom zijn schadelijke bijproducten en schadelijke effecten op het milieu een veelvoorkomend probleem bij deze techniek. Biomining en bioleaching zijn technieken die worden gebruikt om met behulp van levende organismen metalen uit hun erts te winnen.