Het belangrijkste verschil tussen het SIR- en het SEIR-model is dat SIR een van de eenvoudigste modellen van epidemiologie is met drie compartimenten als vatbaar, geïnfecteerd en hersteld, terwijl SEIR een afgeleide is van SIR met vier compartimenten als vatbaar, blootgesteld, geïnfecteerd en hersteld.
Epidemiologie onderzoekt hoe vaak ziekten voorkomen bij verschillende groepen mensen en waarom. Met andere woorden, epidemiologie analyseert de verspreiding, patronen en determinanten van gezondheids- en ziektetoestanden in gedefinieerde populaties. Het heeft compartimentele modellen die wiskundige modellen zijn van infectieziekten. In deze modellen wordt de populatie verdeeld in compartimenten en gebruikt om te voorspellen hoe een ziekte zich verspreidt. SIR en SEIR zijn twee modellen die in de epidemiologie worden gebruikt. SIR is in feite een van de eenvoudigste basismodellen en SEIR is er een uitwerking van. In het SIR-model zijn er drie compartimenten als S, I en R, terwijl er in het SEIR-model vier compartimenten zijn als S, E, I en R.