Het belangrijkste verschil tussen kandidaat-gen en GWAS is dat de kandidaat-genbenadering de genetische variatie onderzoekt binnen een klein aantal vooraf gespecificeerde genen van belang, terwijl GWAS het hele genoom onderzoekt voor een algemene genetische variatie achter een bepaalde ziektetoestand.
Kandidaat-genbenadering en genoombrede associatiestudies (GWAS) zijn twee methoden die belangrijk zijn om genetische gevoeligheid voor ziekten te detecteren. De kandidaat-genbenadering is gebaseerd op een vooraf gespecificeerd klein aantal genen, terwijl GWAS is gebaseerd op het testen van het volledige genoom. Daarom vereist kandidaat-genbenadering voorafgaande kennis van genen die relevant zijn voor de ziekte, in tegenstelling tot GWAS.
