Het belangrijkste verschil tussen Robertsoniaanse translocatie en isochromosoom is dat Robertsoniaanse translocatie een vorm van chromosomale translocatie is waarbij hele lange armen van twee acrocentrische chromosomen worden samengevoegd, terwijl isochromosoom een abnormaal ongebalanceerd chromosoom is dat twee identieke armen heeft als gevolg van duplicatie van één arm en deletie van het andere.
Robertsoniaanse translocatie en isochromosoom zijn twee chromosomale afwijkingen. Bij Robertsoniaanse translocatie zijn bepaalde typen chromosomen aan elkaar gehecht. Het is de meest voorkomende vorm van translocatie bij mensen. Isochromosoom, aan de andere kant, is een abnormaal chromosoom dat twee identieke armen heeft. Deze armen van isochromosoom zijn spiegelbeelden van elkaar.