Het belangrijkste verschil tussen fluorescentie en fosforescentie is dat fluorescentie stopt zodra we de lichtbron verwijderen, terwijl fosforescentie de neiging heeft iets langer te blijven, zelfs nadat de bestralende lichtbron is verwijderd.
Wanneer een molecuul of atoom energie absorbeert, kan het verschillende veranderingen ondergaan. Fluorescentie en fosforescentie zijn twee van dergelijke processen. Naast het bovenstaande belangrijke verschil zijn er enkele andere verschillen tussen de twee termen, zoals de energie die vrijkomt bij het fluorescentieproces hoger is dan die bij de fosforescentie.