Het belangrijkste verschil tussen nephridia en tubuli van Malpighian hangt af van hun voorkomen in organismen. Nephridia zijn aanwezig in lagere organismen zoals wormen en weekdieren, terwijl de tubuli van Malpighian aanwezig zijn in de achterste gebieden van insecten en terrestrische geleedpotigen.
Uitscheiding is een belangrijk aspect van levende organismen. Metabole routes genereren verschillende uitscheidingsproducten als bijproducten. Ophoping van afvalstoffen in een levend lichaamssysteem is echter giftig en schadelijk. Daarom is de aanwezigheid van een mechanisme om metabolisch afval uit het lichaam te verwijderen via een uitscheidingssysteem een must. Daarom zijn verschillende soorten uitscheidingsorganen aanwezig in verschillende groepen organismen. Nephridia en malpighian tubuli zijn twee voorbeelden van dergelijke uitscheidingsorganen.
