De belangrijk verschil tussen chromatine en chromosomen is dat chromatine is ontward en ongevouwen DNA dat bestaat als een complex van DNA en histoneiwitten, terwijl chromosomen de hoogst gecondenseerde structuur van de dubbele DNA-helix bevatten voor de juiste scheiding van het genetisch materiaal tussen dochtercellen.
Chromatine en chromosoom zijn twee categorieën structuren van de dubbele helix van DNA die in verschillende stadia van de cel aanwezig zijn. Het is essentieel om het hele DNA dat genetische informatie van de cel opslaat in de eukaryote kern te stoppen voor bestaan. Daarom is chromatine de gebruikelijke vorm van verpakt DNA in de cel. Aan de andere kant zijn chromosomen de belangrijkste structuren in de cel tijdens de celdeling en bevatten ze het genetisch materiaal in de vorm van DNA. Dit komt omdat ze verantwoordelijk zijn voor de overdracht van erfelijke informatie van de ene generatie op de volgende. Er zijn twee soorten chromosomen: autosomen en geslachtschromosomen. Geslachtschromosomen zijn belangrijk bij het bepalen van het geslacht, terwijl autosomen de andere kenmerken bepalen. Over het algemeen verschijnen chromosomen tijdens de metafase van celdeling.
