Het belangrijkste verschil tussen heterochromatine en euchromatine is dat heterochromatine de sterk gepakte vorm van chromatine is die over het algemeen inactief is, terwijl euchromatine de losjes gepakte vorm van chromatine is die over het algemeen actief is.
Chromatine is de structuur die de DNA-streng van een chromosoom bevat. Heterochromatine en euchromatine zijn de twee belangrijkste soorten chromatine die in de cellen aanwezig zijn. Er is een verschil tussen heterochromatine en euchromatine in termen van structuur en functie. Bovendien verschillen ze ook van de transcriptie- en replicatie-eigenschappen.
