Het belangrijkste verschil tussen bacteriocine en antibioticum is dat bacteriocine een eiwitachtig toxine is dat door bacteriën wordt geproduceerd tegen een nauw verwante bacteriestam, terwijl het antibioticum een antibacteriële stof is en een secundaire metaboliet die de groei van bacteriën doodt of remt.
Antimicrobiële stoffen hebben het vermogen pathogene micro-organismen te doden of hun groei en voortplanting te vertragen. Antimicrobiële middelen kunnen antibacterieel, schimmelwerend of antiviraal zijn. Antibacteriële stoffen of antibiotica werken bacteriën tegen, terwijl antischimmelmiddelen pathogene schimmels tegengaan. Antivirale middelen doden virussen. Daarom zijn antibiotica een soort van meest effectieve antibacteriële stoffen die kunnen worden gebruikt om bacteriële infecties te bestrijden. Bacteriocine is een eiwitachtig toxine dat door bacteriën wordt geproduceerd. Het werkt tegen nauw verwante bacteriestammen. Zowel antibioticum als bacteriocine bezitten dus antibacteriële activiteit.
