Het belangrijkste verschil tussen schimmels en parasieten is dat schimmels een groep eukaryote saprotrofe organismen zijn, waaronder gisten, schimmels en paddenstoelen, terwijl parasieten een groep organismen zijn die op of in een ander organisme leven en voedingsstoffen verkrijgen.
Zowel schimmels als parasieten veroorzaken verschillende ziekten bij mensen. Niet alleen bij mensen, maar parasieten veroorzaken ook ziekten bij andere dieren en planten. Parasieten zijn de organismen die een levenswijze vertonen die parasitisme wordt genoemd. Parasitisme is een van de drie soorten symbiotische relaties die bestaan tussen twee of meer soorten die samen leven. Bepaalde soorten schimmels, sommige insecten, protozoa en wormen zijn voorbeelden van parasieten. Bij parasitisme leven de parasieten op of in een ander organisme dat gastheer wordt genoemd; parasitisme levert alleen voordelen op voor parasieten en veroorzaakt ziekten bij de gastheer. Bovendien kunnen parasieten niet overleven zonder hun gastheren.
