Het belangrijkste verschil tussen de ovariumcyclus en de menstruatiecyclus is dat de ovariële cyclus de cyclus is die plaatsvindt in de eierstokken, terwijl de menstruatiecyclus de cyclus is die plaatsvindt in de baarmoeder die is geassocieerd met de baarmoederwand.
Ovariumcyclus en menstruatiecyclus zijn twee cycli die bij vrouwen voorkomen. Deze twee cycli bereiden een vrouw voor om zwanger te worden, een nageslacht te baren en moeder te worden. Beide cycli komen voor in het vrouwelijke voortplantingssysteem. Het zijn dus hormoongevoelige cycli. Vrouwtjes ondergaan deze twee cycli van puberteit tot menopauze. De reeks gebeurtenissen vindt plaats tijdens deze twee cycli en wordt voornamelijk aangestuurd door de hormonen. Wanneer de zwangerschap optreedt, stoppen beide cycli en dit wordt gedaan door het hormoon humaan choriongonadotrofine (hCG).
