Het belangrijkste verschil tussen de Krebs-cyclus en glycolyse is dat de Krebs-cyclus, die plaatsvindt in mitochondriën, de tweede fase is van cellulaire ademhaling, terwijl glycolyse, die plaatsvindt in het cytoplasma, de eerste fase is van cellulaire ademhaling.
De cyclus van Krebs en de glycolyse zijn twee hoofdfasen van cellulaire ademhaling die energie in cellen produceert. Beide processen vinden plaats op verschillende cellulaire locaties. Bovendien gebruiken ze verschillende enzymatische reacties om verschillende uitgangsmaterialen om te zetten in verschillende producten. Bovendien creëren deze twee processen verschillende hoeveelheden ATP. Bij aërobe ademhaling volgt de Krebs-cyclus de glycolyse. Maar bij anaërobe ademhaling vindt glycolyse alleen plaats.