Het belangrijkste verschil tussen cytosol en s9-fractie is dat cytosol een vloeistoffase is die bestaat uit structurele componenten van een cel behalve de kern, terwijl s9-fractie de supernatantfractie is die wordt verkregen uit een orgaanhomogenaat door de lage snelheidscentrifugatie in een geschikt medium.
Cytosol en S9-fractie zijn twee componenten die verband houden met cellen. Het cytosol is de vloeistof waarin de celorganellen zijn gesuspendeerd. In eenvoudige bewoordingen is het de vloeibare fase die wordt aangetroffen in het plasmamembraan van een cel. S9-fractie is het supernatant dat wordt verkregen door centrifugeren op lage snelheid van een weefsel- of orgaanhomogenaat. Het is nuttig in biologische testen om het metabolisme van geneesmiddelen en andere xenobiotica te meten.