Het belangrijkste verschil tussen HPLC met omgekeerde fase en normale fase is dat de HPLC met omgekeerde fase een niet-polaire stationaire fase en een polaire mobiele fase gebruikt, terwijl de HPLC met normale fase een polaire stationaire fase en een minder polaire mobiele fase gebruikt.
De normale fase HPLC is de oudste techniek van HPLC die Tswett gebruikte bij het scheiden van plantenextracten; hij gebruikte krijt in een glazen kolom. Dit was de klassieke manier van chromatografie die ertoe leidde dat het de "normale" techniek werd genoemd. Omgekeerde-fase-HPLC daarentegen is het tegenovergestelde van de normale techniek die wetenschappers onlangs hebben ontwikkeld.
