Het belangrijkste verschil tussen geitonogamie en xenogamie is dat geitonogamie de overdracht is van stuifmeel op het stigma van een andere bloem van dezelfde plant, terwijl xenogamie de overdracht is van stuifmeel op het stigma van een andere bloem die tot een genetisch andere plant behoort. Geitonogamie is een soort zelfbestuiving, terwijl xenogamie een soort kruisbestuiving is.
Angiospermen zijn afhankelijk van bestuiving voor bevruchting en productie van zaden. Pollen van helmknoppen gaan tijdens de bestuiving over in het stigma van stampers. Bestuiving kan plaatsvinden tussen mannelijke en vrouwelijke delen van dezelfde bloem of tussen twee bloemen van dezelfde plant of tussen twee bloemen van de verschillende planten. Als bestuiving plaatsvindt tussen twee bloemen van dezelfde plant, staat het bekend als geitonogamie, terwijl als het voorkomt tussen twee bloemen van de verschillende planten, het bekend staat als xenogamie.
