Het belangrijkste verschil tussen V-type en F-type ATPase is dat V-type ATPase werkt als een ATP-aangedreven ionenpomp, terwijl F-type ATPase functioneert als ATP-synthase in cellen.
ATPase is een term die verwijst naar enzymen die ATP kunnen hydrolyseren. Over het algemeen breken ATPasen ATP af en de energie die vrijkomt tijdens de reactie wordt gebruikt om werk te doen, aangezien ATP de energiemunteenheid is die energie levert voor alle vrijwel alle cellulaire processen. ATP-uitsplitsing heeft ATPases nodig. Daarom verlagen ATPases de activeringsenergie van ATP-hydrolyse. Er zijn vier hoofdtypen ATPases als F-ATPases, V-ATPases, A-ATPases en P-ATPases. ATPasen van het V-type worden voornamelijk aangetroffen in vacuolen van eukaryote cellen. Daarentegen worden F-type ATPases aangetroffen in bacteriële plasmamembranen, mitochondriën binnenmembraan en chloroplasten. Ze katalyseren de hydrolyse of synthese van ATP-koppeling met H + (of Na +) transport over een membraan.
