Het belangrijkste verschil tussen Aspergillus en Penicillium is dat Aspergill us een geslacht is van ascomycetes-schimmels met een onvertakte en niet-septate conidiofoor, terwijl Penicillium een ander geslacht is van ascomycetes-schimmels met een vertakte, septate en borstelachtige conidiofoor.
Ascomycota is een stam van Kingdom Fungi. In feite is het de grootste stam van schimmels met ongeveer 64.000 beschreven soorten. Het zijn filamenteuze septaatschimmels. Ze reproduceren via ascosporen die worden geproduceerd in de zakachtige structuur die ascus wordt genoemd. De meeste ascomyceten-schimmels maken symbiotische relaties met algen of cyanobacteriën en vormen korstmossen. Bovendien helpen ze ook bij de vorming van mycorrhizae. Sommige ascomyceten produceren antibiotica, terwijl andere fungeren als modelorganismen in genetica en celbiologische studies. Niet alleen dat, veel soorten veroorzaken planten- en dierziekten. Onder de vele verschillende geslachten van ascomyceten zijn Aspergillus en Penicillium twee populaire en belangrijke geslachten.