Het belangrijkste verschil tussen allo-antilichaam en auto-antilichaam is dat het allo-antilichaam een antilichaam is dat wordt geproduceerd tegen allo-antigenen, die vreemde antigenen zijn die worden geïntroduceerd door transfusie of zwangerschap. Ondertussen is het auto-antilichaam een antilichaam dat reageert met eigen antigenen.
Antilichamen worden geproduceerd als gevolg van een immuunrespons. Ze kunnen de aanwezigheid, aard en intensiteit van een immuunrespons weerspiegelen. Het immuunsysteem moet in staat zijn om zelf-antigenen en vreemde antigenen afzonderlijk te identificeren. Het is cruciaal voor zijn functie. B-cellen van het immuunsysteem produceren antilichamen tegen antigenen. Allo-antilichamen en auto-antilichamen zijn twee soorten van dergelijke antilichamen. Allo-antilichamen worden geproduceerd door de introductie van allo-antigenen in het lichaam door transfusie of zwangerschap. Auto-antilichamen zijn daarentegen antilichamen die reageren met eigen antigenen. De reactie van auto-antilichamen met eigen antigenen is verantwoordelijk voor ontsteking, beschadiging en disfunctie van weefsels en organen, wat leidt tot tekenen en symptomen van auto-immuunziekten.
