Het belangrijkste verschil tussen pathofysiologie en pathogenese is dat pathofysiologie de aandoeningen verklaart die typisch worden waargenomen tijdens een ziektetoestand, evenals de processen of mechanismen die binnen een organisme werken, terwijl pathogenese de oorsprong en ontwikkeling van een ziekte verklaart en of de ziekte acuut, chronisch of recidiverend is.
Pathofysiologie en pathogenese zijn twee vergelijkbare termen die worden gebruikt om het optreden van een ziekte en gerelateerde mechanismen en kenmerken te verklaren. Pathofysiologie betreft de condities die worden waargenomen tijdens een ziektetoestand en de processen die plaatsvinden binnen een organisme. Pathogenese richt zich vooral op het ontstaan en ontstaan van een ziekte. Beide onderzoeken zijn belangrijk om een ziekte te diagnosticeren en de verspreiding ervan te voorkomen.
