De belangrijk verschil tussen protoxyleem en metaxyleem is dat protoxyleem het eerste gevormde primaire xyleem is met kleinere cellen, vooral smalle vaten en tracheïden, terwijl metaxyleem het later gevormde primaire xyleem is met grotere cellen, vooral bredere vaten, en tracheïden.
Xylem is een van de twee soorten vaatweefsel in planten. Xylem voert opwaartse bewegingen van water en mineralen uit van wortels naar de andere delen van de plant. Het is een buisachtige structuur met verschillende soorten gespecialiseerde cellen, waaronder bloedvatelementen, tracheïden, parenchym en vezels. Er zijn twee soorten xyleem als primair xyleem en secundair xyleem. Primair xyleem ontwikkelt zich tijdens de primaire groei. Bovendien bestaat primair xyleem uit twee delen: protoxyleem en metaxyleem. Zowel protoxyleem als metaxyleem zijn afkomstig van het pro-cambium tijdens de primaire groei. Protoxyleem ontstaat eerst en metaxyleem ontstaat na het protoxyleem.