Het belangrijkste verschil tussen bacteriën en mollicuten is dat bacteriën over het algemeen een peptidoglycaancelwand hebben, terwijl mollicuten een klasse bacteriën zijn die geen celwand hebben.
Bacteriën zijn de meest voorkomende micro-organismen die in de natuur voorkomen. Ze zijn een groep eencellige organismen die overal leven. Bovendien zijn het prokaryote organismen. Daarom missen ze een kern en membraangebonden organellen. Er zijn verschillende groepen bacteriën. Sommigen van hen behoren tot een fotosynthetische bacteriegroep die cyanobacteriën wordt genoemd. Over het algemeen hebben de meeste bacteriën een stijve celwand. Sommige bacteriegroepen hebben deze celwand echter niet. Mollicuten zijn zo'n klasse bacteriën die geen celwand hebben. Daarom bespreekt dit artikel het verschil tussen bacteriën en mollicuten.