Het belangrijkste verschil tussen willekeurige en bedrukte X-inactivering is dat willekeurige X-inactivering de inactivering is van een vaderlijk of moederlijk X-chromosoom met gelijke waarschijnlijkheid tijdens de gastrulatie in de epiblast, terwijl bedrukte X-inactivering een niet-willekeurige X-inactivering is van de vaderlijk afgeleide X chromosoom in de extraembryonale weefsels van zoogdieren.
X-inactivering is een proces dat wordt waargenomen bij vrouwelijke zoogdieren. Over het algemeen hebben vrouwtjes twee X-chromosomen. En bij vrouwelijke zoogdieren wordt één X-chromosoom inactief. Met andere woorden, één X-chromosoom wordt een transcriptioneel inactieve structuur. Zodra dit gebeurt, blijft dit specifieke X-chromosoom inactief gedurende de hele levensduur van de cel en zijn nakomelingen in het organisme. Bovendien condenseert het geïnactiveerde X-chromosoom tot een compacte structuur, een Barr-lichaam genaamd, en wordt het stabiel in een stille toestand gehouden. Ook hangt het X-inactiveringsproces af van de controle van twee niet-coderende complementaire RNA's. De X-inactivering vindt echter niet plaats bij mannen, die slechts één X-chromosoom hebben. Bovendien kan X-inactivering willekeurig plaatsvinden of door inprenting.
