Belangrijkste verschil - Eukaryote versus prokaryote promotors
Transcriptie is het proces waarbij de genetische informatie die is opgeslagen in de coderende DNA-sequentie, wordt omgezet in mRNA-sequentie. Een specifiek DNA-gebied aan het 5'-uiteinde van de transcriptionele eenheid start dit proces. Dat gebied staat bekend als het promotorgebied. Deze promotors worden typisch gevonden naast de transcriptiestartplaats. De lengte van een promotor varieert van 100 bp tot 1000 bp. Promotors zijn verschillend volgens het type organisme. Eukaryote en prokaryote promotors verschillen van elkaar. In prokaryoten worden slechts drie soorten promotersequenties gevonden, namelijk -10 promoters, -35 promoter en stroomopwaartse elementen. In eukaryoten zijn er veel verschillende promotorelementen zoals TATA-box, initiatorelementen, GC-box, CAAT-box, enz. Dit is het belangrijkste verschil tussen eukaryote en prokaryote promotors.
INHOUD
1. Overzicht en belangrijkste verschil
2. Wat zijn eukaryote promotors
3. Wat zijn prokaryote promotors
4. Overeenkomsten tussen eukaryote en prokaryote promotors
5. Vergelijking zij aan zij - Eukaryote versus prokaryote promotors in tabelvorm
6. Samenvatting
Wat zijn eukaryote promotors?
Drie hoofdporties; kernpromotor, proximale promotor en distale promotor, vormen samen een promotor. In de context van eukaryoten zijn er veel aantallen promotorelementen die zeer geavanceerd en diverser zijn dan promotors. Er is ontdekt dat, vanwege deze complexiteit van de eukaryote promoters, het DNA het vermogen heeft om zichzelf terug te vouwen. Dit verklaart ook het feit dat het effect van veel regulerende sequenties plaatsvindt, ook al bevinden ze zich vele kilobasen verwijderd van de plaats van transcriptie. Deze eukaryote promoters kunnen een breed scala aan DNA-sequenties overspannen.
Figuur 01: Eukaryotische promotor
Voorbeelden voor sommige eukaryote promotors zijn Pribnow-box (TATA-box), GC-box, CAAT-box enz. In de context van TATA-box is het een sequentie van 5 '- TATAA -3' die aanwezig is in het kernpromotorgebied. Aan de TATA-box zijn transcriptiefactoreiwitten en histoneiwitten gebonden. De binding van transcriptiefactoreiwitten aan de TATA-box helpt bij de binding van RNA-polymerase, wat vervolgens resulteert in de vorming van transcriptiecomplexen. Simpel gezegd, de binding van deze eiwitten zal het transcriptieproces aansturen. Dit proces wordt geremd wanneer histoneiwitten aan de TATA-box worden gebonden. Daarom is de TATA-box een belangrijk promotorelement dat betrekking heeft op de regulering van de snelheid van eukaryote transcriptie.
Wat zijn prokaryotische promotors?
In prokaryote organismen wordt de promotor die betrokken is bij transcriptie geïdentificeerd door de geassocieerde factor die sigma-factor wordt genoemd. Sigma-factoren zijn uniek voor verschillende promotersequenties. Daarom wordt gezegd dat elke enkele sigmafactor een enkele promotorsequentie van de kern zou herkennen. Dit is een uniek kenmerk dat aanwezig is in het prokaryotische transcriptieproces. Zowel RNA-polymerase als de sigmafactor identificeren gezamenlijk het juiste promotorgebied en vormen het transcriptiecomplex.
De prokaryote promotor bevat slechts drie soorten promotorelementen. De geringere betrokkenheid van promotorelementen bij prokaryoten is de belangrijkste reden waarom hun transcriptieproces minder geavanceerd is in vergelijking met eukaryote transcriptie waarbij een groter aantal promotorsequenties betrokken is. Van de drie promotorelementen van prokaryoten zijn er twee belangrijke twee korte DNA-sequenties. Deze reeksen zijn geclassificeerd op basis van hun locatie. Het zijn -10 promotors of element (dat wil zeggen 10 bp stroomopwaarts van transcriptie startplaats), -35 promotors of element (dat wil zeggen 35 bp stroomopwaarts van transcriptie startplaats).
Figuur 02: Prokaryotische promotor
De -10-promotor is equivalent aan de eukaryote TATA-box of Pribnow-box en is een essentieel onderdeel voor de initiatie van transcriptie in prokaryoten. De -35-promotor bestaat uit een sequentie die TTGACA is en die actief betrokken is bij de regulering van de snelheid van prokaryote transcriptie.
Wat zijn de overeenkomsten tussen eukaryote en prokaryote promotors?
- In beide typen worden de promoters gecontroleerd door verschillende DNA-regulerende sequenties die enhancers, dempers, isolatoren en grenselementen omvatten.
- Promotors zijn de sequenties die de transcriptie in prokaryoten en eukaryoten initiëren.
- Promotors zijn DNA-sequenties.
Wat is het verschil tussen eukaryote en prokaryote promotors?
Diff Artikel Midden voor Tafel
Eukaryote versus prokaryote promotors |
|
| Eukaryote promoters zijn de regulerende sequenties die de transcriptie van eukaryote organismen initiëren. | Prokaryote promoters zijn de regulerende sequenties die de transcriptie van prokaryote genen initiëren. |
| Elementen | |
| Prokaryote promotor bestaat uit stroomopwaartse elementen, -10 element en -35 elementen. | Eukaryote promotor bestaat uit Pribnow-box (TATA-box), CAAT-box, GC-box en initiatorelementen. |
Samenvatting - Eukaryote versus prokaryote promotors
Een promotor is een DNA-regio waarbij het proces dat transcriptie wordt genoemd, wordt gestart. Deze promotors worden doorgaans stroomopwaarts van de startplaats van de transcriptie gevonden. De drie belangrijkste delen die een promotor vormen, zijn kernpromotor, proximale promotor en distale promotor. In de context van eukaryoten zijn er veel aantal bevorderende elementen in het promotorgebied die zeer geavanceerd en diverser zijn dan prokaryoten. Voorbeelden van sommige eukaryote promotorelementen zijn Pribnow-box (TATA-box), GC-box, CAAT-box enz. In prokaryoten zijn er twee belangrijke promotorelementen, namelijk -10 element (dat is 10 bp stroomopwaarts van transcriptiestartplaats), -35 elementen (dat is aanwezig 35 bp stroomopwaarts van de startplaats van de transcriptie). -10-promotor initieert de transcriptie en de -35-promotor reguleert transcriptie. Beide soorten promotors worden gecontroleerd door verschillende DNA-regulerende sequenties die enhancers, dempers, isolatoren en grenselementen omvatten. Dit is het verschil tussen eukaryote en prokaryote promotors.
Download de pdf van eukaryotische versus prokaryotische promotors
U kunt de pdf-versie van dit artikel downloaden en offline gebruiken volgens de citatienota. Download de pdf-versie hier: Verschil tussen eukaryotische en prokaryotische promotor
