De belangrijk verschil tussen prezygoot en postzygoot is dat het prezygote een mechanisme is van reproductieve isolatie, dat de bevruchting van het ei voorkomt, terwijl het postzygote een mechanisme is van reproductieve isolatie, dat de vorming van levensvatbare of vruchtbare nakomelingen voorkomt.
Een soort is een groep organismen die zich in de natuur seksueel met elkaar kunnen voortplanten en vruchtbare nakomelingen kunnen voortbrengen. In het evolutionaire aspect is soortvorming een belangrijk concept. Soort is een reproductief geïsoleerde groep. Prezygoot en postzygoot zijn twee belangrijke reproductieve isolatiemechanismen. De reproductieve isolatie die plaatsvindt vóór de bevruchting, is de prezygote isolatie. Terwijl de reproductieve isolatie die optreedt na de bevruchting en die voorkomt dat het bevruchte ei een vruchtbaar nageslacht wordt, de post-zygotische isolatie is.