Het belangrijkste verschil tussen Prostaglandine E1 en E2 is dat de prostaglandine E1 (PGE1) een ontstekingsremmende factor is, terwijl de Prostaglandine E2 (PGE2) een pro-inflammatoire factor is.
Prostaglandinen zijn van lipiden afgeleide verbindingen die een hormoonachtige functie hebben. Ze kunnen werken als autocriene of paracriene verbindingen die antagonistische of synergetische effecten in de levende organismen teweegbrengen. Prostaglandine E1 en prostaglandine E2 zijn twee typen, en ze verschillen in de functionaliteit bij ontstekingen. Zowel prostaglandine E1 als E2 behoren tot dezelfde familie van prostaglandine E2, en hun reactiebasis en hun effecten zijn nog niet volledig opgehelderd. Ze worden gebruikt bij de behandelingen van verschillende biochemische mechanismen bij levende wezens.
