Het belangrijkste verschil tussen dominante en recessieve allelen is dat dominante allelen de allelen zijn die het fenotype geven, maskeren over het andere fenotype, terwijl recessieve allelen de allelen zijn die worden onderdrukt door het dominante allel.
Gewoonlijk bevat een chromosoom een aantal genen, die op specifieke plaatsen voorkomen. Als er genen op dezelfde locatie in de homologe chromosomen voorkomen, wordt gezegd dat ze dezelfde locus hebben. Omdat ze op dezelfde loci van het maternale en vaderlijke chromosoom aanwezig zijn, hebben deze genen dezelfde eigenschap. Het zijn de alternatieve vormen van een gen; we noemen deze allelen. Allelen kunnen dominant of recessief zijn. Een dominant allel geeft altijd het fenotype dat het codeert, terwijl het recessieve allel het fenotype alleen geeft als het aanwezig is in de homozygote toestand. In feite zijn dominantie en recessiviteit de fenotypische correlatie van twee allelen.