De belangrijk verschil tussen septate en aseptate hyfen is dat septate hyfen septa of dwarswanden hebben die hyfen in verschillende cellen verdelen, terwijl aseptate hyfen septa missen.
Hyphae zijn lange filamenten of draadachtige structuren van schimmels. Hyphae vertegenwoordigen de vegetatieve structuur van schimmels. Mycelium is de verzameling hyfen van een schimmel. Schimmelhyfen bestaan uit cellen omgeven door een celwand gemaakt van chitine. Om cellen in de hyfen te scheiden, zijn er geperforeerde dwarswanden die septa worden genoemd. Maar septa zijn niet aanwezig in hyfen van alle schimmels. Daarom hebben hyfen, op basis van de aan- en afwezigheid van septa, twee soorten: septate hyfen en aseptate hyfen.
