Het belangrijkste verschil tussen gelijkenis en identiteit bij sequentie-uitlijning is dat gelijkenis de gelijkenis (gelijkenis) is tussen twee reeksen in vergelijking, terwijl identiteit het aantal tekens is dat precies overeenkomt tussen twee verschillende reeksen.
Bio-informatica is een interdisciplinair wetenschapsgebied dat voornamelijk betrekking heeft op moleculaire biologie en genetica, informatica, wiskunde en statistiek. Sequentie-uitlijning is een belangrijke term in bio-informatica. Het is de procedure waarbij de sequenties van DNA, RNA of eiwit worden gerangschikt om gebieden van gelijkenis te identificeren die een gevolg zijn van functionele, structurele of evolutionaire relatie tussen de sequenties. Aan het einde van de uitlijning worden ze weergegeven als rijen in een matrix. Om de identieke karakters in opeenvolgende kleuren uit te lijnen, zijn tussen de residuen ingevoegde gaten aanwezig.
