Het belangrijkste verschil tussen DMSO en MSM is dat DMSO een organozwavelverbinding is die in de vloeibare fase bestaat, terwijl MSM een organozwavelverbinding is die in de vaste fase voorkomt.
De term DMSO staat voor dimethylsulfoxide terwijl de term MSM staat voor methylsulfonylmethaan. Beide zijn organozwavelverbindingen. Dat betekent; deze verbindingen hebben zwavelatomen gebonden aan organische verbindingen. Het belangrijkste verschil tussen DMSO en MSM ligt in de fase van materie waarin deze verbindingen bij kamertemperatuur voorkomen. Naast dit belangrijke verschil zijn er nog enkele andere verschillen.
