Het belangrijkste verschil tussen Agnathans en Gnathostomata is dat Agnathans organismen zijn die geen kaak hebben, terwijl Gnathostomata organismen met kaken zijn. Dit belangrijke verschil speelt een grote rol in de vorm van voeding die ze ondergaan.
Agnathans zijn kaakloze vissen. Gnathostomata zijn vissen met kaken. Zowel agnathans als Gnathostomata zijn erg belangrijk bij het bepalen van evolutionaire relaties. Het zijn gewervelde dieren en leven in aquatische omgevingen. Ze laten verschillende patronen zien om te overleven. De vroegste organismen van elke groep zijn nu echter uitgestorven.